Project measure / variable:   Chesler3   litter_size

ID, description, units MPD:43541   litter_size   number of mice born in first litter   [n]  
Data set, strains Chesler3   CC pre w/par   312 strains     sex: both     age: 4wks
Procedure colony observation
Ontology mappings

  STRAIN COMPARISON PLOT
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Chesler3 - number of mice born in first litter



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested299 strains296 strains
Mean of the strain means4.31   n 4.39   n
Median of the strain means4.00   n 4.33   n
SD of the strain means± 1.68 ± 1.68
Coefficient of variation (CV)0.391 0.383
Min–max range of strain means1.00   –   9.00   n 1.00   –   9.00   n
Mean sample size per strain2.4   mice 2.3   mice


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
129S1/SvImJ f 4.43 1.99   7 0.751 0.449 1.0, 7.0 0.07
129S1/SvImJ m 5.0 0.894   6 0.365 0.179 4.0, 6.0 0.36
A/J f 6.33 1.15   3 0.667 0.182 5.0, 7.0 1.2
A/J m 6.33 1.15   3 0.667 0.182 5.0, 7.0 1.15
C57BL/6J f 6.88 2.03   17 0.492 0.295 3.0, 11.0 1.53
C57BL/6J m 6.89 2.01   46 0.297 0.292 2.0, 11.0 1.49
CAST/EiJ f 5.75 0.5   4 0.25 0.087 5.0, 6.0 0.86
CAST/EiJ m 4.67 2.16   6 0.882 0.463 2.0, 8.0 0.17
NOD/ShiLtJ f 8.0 2.83   6 1.15 0.354 4.0, 11.0 2.2
NOD/ShiLtJ m 8.5 3.11   4 1.55 0.366 4.0, 11.0 2.45
NZO/HlLtJ f 6.17 1.6   6 0.654 0.26 5.0, 9.0 1.11
NZO/HlLtJ m 6.0 2.65   3 1.53 0.441 4.0, 9.0 0.96
PreCCF0003/Ornl f 6.25 4.19   4 2.1 0.671 2.0, 12.0 1.16
PreCCF0003/Ornl m 7.67 3.79   3 2.19 0.494 5.0, 12.0 1.95
PreCCF0013/Ornl f 4.5 1.91   4 0.957 0.426 2.0, 6.0 0.12
PreCCF0013/Ornl m 4.0 2.0   3 1.15 0.5 2.0, 6.0 -0.23
PreCCF0015/Ornl f 4.25 1.89   4 0.946 0.445 3.0, 7.0 -0.03
PreCCF0015/Ornl m 4.67 2.08   3 1.2 0.446 3.0, 7.0 0.17
PreCCF0020/Ornl f 4.0 1.41   2   1.0 0.354 3.0, 5.0 -0.18
PreCCF0020/Ornl m 4.67 1.53   3 0.882 0.327 3.0, 6.0 0.17
PreCCF0027/Ornl f 8.0 0.0   1   0.0 0.0 8.0, 8.0 2.2
PreCCF0027/Ornl m 8.0 0.0   1   0.0 0.0 8.0, 8.0 2.15
PreCCF0041/Ornl f 6.0 1.0   3 0.577 0.167 5.0, 7.0 1.01
PreCCF0041/Ornl m 5.5 0.707   2   0.5 0.129 5.0, 6.0 0.66
PreCCF0044/Ornl f 3.5 2.08   4 1.04 0.595 1.0, 6.0 -0.48
PreCCF0044/Ornl m 6.0 0.0   1   0.0 0.0 6.0, 6.0 0.96
PreCCF0053/Ornl m 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.83
PreCCF0055/Ornl f 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.41
PreCCF0055/Ornl m 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.36
PreCCF0063/Ornl f 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.41
PreCCF0063/Ornl m 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.36
PreCCF0065/Ornl f 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.18
PreCCF0065/Ornl m 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.23
PreCCF0070/Ornl f 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.37
PreCCF0070/Ornl m 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.42
PreCCF0071/Ornl f 8.0 0.0   1   0.0 0.0 8.0, 8.0 2.2
PreCCF0071/Ornl m 8.0 0.0   1   0.0 0.0 8.0, 8.0 2.15
PreCCF0072/Ornl f 4.67 0.577   3 0.333 0.124 4.0, 5.0 0.22
PreCCF0072/Ornl m 5.33 0.577   3 0.333 0.108 5.0, 6.0 0.56
PreCCF0079/Ornl f 4.0 2.83   2   2.0 0.707 2.0, 6.0 -0.18
PreCCF0079/Ornl m 4.0 2.83   2   2.0 0.707 2.0, 6.0 -0.23
PreCCF0083/Ornl f 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.78
PreCCF0083/Ornl m 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.83
PreCCF0088/Ornl m 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.36
PreCCF0091/Ornl f 5.67 2.66   6 1.09 0.469 3.0, 9.0 0.81
PreCCF0091/Ornl m 5.67 2.66   6 1.09 0.469 3.0, 9.0 0.76
PreCCF0092/Ornl f 5.0 0.0   3 0.0 0.0 5.0, 5.0 0.41
PreCCF0092/Ornl m 5.0 0.0   3 0.0 0.0 5.0, 5.0 0.36
PreCCF0094/Ornl f 4.0 1.41   2   1.0 0.354 3.0, 5.0 -0.18
PreCCF0094/Ornl m 4.0 1.41   2   1.0 0.354 3.0, 5.0 -0.23
PreCCF0113/Ornl f 6.4 1.82   5 0.812 0.284 4.0, 8.0 1.24
PreCCF0113/Ornl m 6.75 1.89   4 0.946 0.28 4.0, 8.0 1.4
PreCCF0125/Ornl f 6.0 3.46   3 2.0 0.577 2.0, 8.0 1.01
PreCCF0125/Ornl m 6.0 3.46   3 2.0 0.577 2.0, 8.0 0.96
PreCCF0134/Ornl f 3.25 1.71   4 0.854 0.525 1.0, 5.0 -0.63
PreCCF0134/Ornl m 4.5 0.707   2   0.5 0.157 4.0, 5.0 0.07
PreCCF0138/Ornl f 3.86 2.34   7 0.884 0.607 1.0, 7.0 -0.27
PreCCF0138/Ornl m 4.4 2.41   5 1.08 0.547 2.0, 7.0 0.01
PreCCF0145/Ornl f 6.0 1.41   2   1.0 0.236 5.0, 7.0 1.01
PreCCF0145/Ornl m 6.0 1.41   2   1.0 0.236 5.0, 7.0 0.96
PreCCF0146/Ornl f 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.37
PreCCF0146/Ornl m 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.42
PreCCF0147/Ornl f 4.33 1.53   3 0.882 0.353 3.0, 6.0 0.01
PreCCF0147/Ornl m 5.0 1.41   2   1.0 0.283 4.0, 6.0 0.36
PreCCF0157/Ornl f 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.18
PreCCF0157/Ornl m 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.23
PreCCF0166/Ornl f 2.25 0.5   4 0.25 0.222 2.0, 3.0 -1.22
PreCCF0166/Ornl m 2.33 0.577   3 0.333 0.247 2.0, 3.0 -1.23
PreCCF0167/Ornl f 6.8 3.19   5 1.43 0.47 2.0, 9.0 1.48
PreCCF0167/Ornl m 6.83 2.86   6 1.17 0.418 2.0, 9.0 1.45
PreCCF0170/Ornl f 4.0 1.73   3 1.0 0.433 2.0, 5.0 -0.18
PreCCF0170/Ornl m 4.0 1.73   3 1.0 0.433 2.0, 5.0 -0.23
PreCCF0176/Ornl f 2.0 1.41   2   1.0 0.707 1.0, 3.0 -1.37
PreCCF0176/Ornl m 1.0 0.0   1   0.0 0.0 1.0, 1.0 -2.02
PreCCF0181/Ornl f 3.83 1.72   6 0.703 0.449 1.0, 6.0 -0.28
PreCCF0181/Ornl m 3.83 1.72   6 0.703 0.449 1.0, 6.0 -0.33
PreCCF0189/Ornl f 5.67 3.21   3 1.86 0.567 2.0, 8.0 0.81
PreCCF0189/Ornl m 5.25 2.75   4 1.38 0.525 2.0, 8.0 0.51
PreCCF0190/Ornl f 3.67 1.53   3 0.882 0.417 2.0, 5.0 -0.38
PreCCF0190/Ornl m 3.83 1.17   6 0.477 0.305 2.0, 5.0 -0.33
PreCCF0200/Ornl f 8.0 0.0   1   0.0 0.0 8.0, 8.0 2.2
PreCCF0200/Ornl m 8.0 0.0   1   0.0 0.0 8.0, 8.0 2.15
PreCCF0205/Ornl f 2.0 1.0   3 0.577 0.5 1.0, 3.0 -1.37
PreCCF0205/Ornl m 2.0 1.0   3 0.577 0.5 1.0, 3.0 -1.42
PreCCF0209/Ornl f 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.78
PreCCF0209/Ornl m 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.83
PreCCF0210/Ornl f 7.0 1.41   2   1.0 0.202 6.0, 8.0 1.6
PreCCF0210/Ornl m 7.0 1.41   2   1.0 0.202 6.0, 8.0 1.55
PreCCF0216/Ornl f 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.37
PreCCF0219/Ornl f 4.33 2.08   3 1.2 0.48 2.0, 6.0 0.01
PreCCF0219/Ornl m 4.33 2.08   3 1.2 0.48 2.0, 6.0 -0.04
PreCCF0220/Ornl f 3.5 0.707   2   0.5 0.202 3.0, 4.0 -0.48
PreCCF0220/Ornl m 3.5 0.707   2   0.5 0.202 3.0, 4.0 -0.53
PreCCF0222/Ornl f 8.0 0.0   1   0.0 0.0 8.0, 8.0 2.2
PreCCF0222/Ornl m 8.0 0.0   1   0.0 0.0 8.0, 8.0 2.15
PreCCF0232/Ornl f 7.0 1.0   3 0.577 0.143 6.0, 8.0 1.6
PreCCF0232/Ornl m 7.0 1.0   3 0.577 0.143 6.0, 8.0 1.55
PreCCF0237/Ornl f 7.0 2.0   3 1.15 0.286 5.0, 9.0 1.6
PreCCF0237/Ornl m 6.6 1.52   5 0.678 0.23 5.0, 9.0 1.31
PreCCF0238/Ornl f 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.37
PreCCF0238/Ornl m 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.42
PreCCF0256/Ornl f 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.78
PreCCF0256/Ornl m 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.83
PreCCF0268/Ornl f 6.0 1.41   2   1.0 0.236 5.0, 7.0 1.01
PreCCF0268/Ornl m 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.36
PreCCF0278/Ornl f 4.5 2.89   4 1.44 0.642 2.0, 7.0 0.12
PreCCF0278/Ornl m 4.5 2.89   4 1.44 0.642 2.0, 7.0 0.07
PreCCF0289/Ornl f 4.0 0.0   2   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.18
PreCCF0289/Ornl m 2.67 1.15   3 0.667 0.433 2.0, 4.0 -1.02
PreCCF0290/Ornl f 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.78
PreCCF0290/Ornl m 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.83
PreCCF0291/Ornl f 6.0 1.0   3 0.577 0.167 5.0, 7.0 1.01
PreCCF0291/Ornl m 6.0 1.0   3 0.577 0.167 5.0, 7.0 0.96
PreCCF0292/Ornl f 2.0 0.0   1   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.37
PreCCF0299/Ornl f 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.41
PreCCF0299/Ornl m 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.36
PreCCF0304/Ornl f 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.41
PreCCF0304/Ornl m 3.0 0.0   1   0.0 0.0 3.0, 3.0 -0.83
PreCCF0305/Ornl f 4.4 1.82   5 0.812 0.413 2.0, 6.0 0.06
PreCCF0305/Ornl m 4.4 1.82   5 0.812 0.413 2.0, 6.0 0.01
PreCCF0334/Ornl f 5.0 3.0   3 1.73 0.6 2.0, 8.0 0.41
PreCCF0334/Ornl m 5.0 3.0   3 1.73 0.6 2.0, 8.0 0.36
PreCCF0353/Ornl f 8.0 2.83   2   2.0 0.354 6.0, 10.0 2.2
PreCCF0353/Ornl m 8.33 2.08   3 1.2 0.25 6.0, 10.0 2.34
PreCCF0361/Ornl m 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.23
PreCCF0363/Ornl f 3.33 1.53   3 0.882 0.458 2.0, 5.0 -0.58
PreCCF0363/Ornl m 3.33 1.53   3 0.882 0.458 2.0, 5.0 -0.63
PreCCF0366/Ornl f 9.0 0.0   1   0.0 0.0 9.0, 9.0 2.79
PreCCF0377/Ornl f 7.0 0.0   1   0.0 0.0 7.0, 7.0 1.6
PreCCF0377/Ornl m 7.0 0.0   1   0.0 0.0 7.0, 7.0 1.55
PreCCF0380/Ornl f 4.57 1.51   7 0.571 0.331 2.0, 7.0 0.16
PreCCF0380/Ornl m 4.6 0.548   5 0.245 0.119 4.0, 5.0 0.12
PreCCF0381/Ornl f 4.25 1.5   4 0.75 0.353 3.0, 6.0 -0.03
PreCCF0381/Ornl m 4.33 1.53   3 0.882 0.353 3.0, 6.0 -0.04
PreCCF0388/Ornl f 4.5 2.89   4 1.44 0.642 1.0, 8.0 0.12
PreCCF0388/Ornl m 4.5 2.89   4 1.44 0.642 1.0, 8.0 0.07
PreCCF0391/Ornl m 3.0 1.41   2   1.0 0.471 2.0, 4.0 -0.83
PreCCF0409/Ornl f 5.0 1.41   2   1.0 0.283 4.0, 6.0 0.41
PreCCF0409/Ornl m 5.33 1.15   3 0.667 0.217 4.0, 6.0 0.56
PreCCF0419/Ornl f 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.18
PreCCF0419/Ornl m 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.23
PreCCF0425/Ornl f 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.18
PreCCF0425/Ornl m 4.0 0.0   1   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.23
PreCCF0449/Ornl f 6.0 4.24   2   3.0 0.707 3.0, 9.0 1.01
PreCCF0449/Ornl m 9.0 0.0   1   0.0 0.0 9.0, 9.0 2.74
PreCCF0453/Ornl f 4.0 0.0   2   0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.18
PreCCF0453/Ornl m 4.0 0.0   3 0.0 0.0 4.0, 4.0 -0.23
PreCCF0457/Ornl f 4.0 1.73   3 1.0 0.433 3.0, 6.0 -0.18
PreCCF0457/Ornl m 4.0 1.41   4 0.707 0.354 3.0, 6.0 -0.23
PreCCF0462/Ornl f 3.25 2.63   4 1.31 0.809 1.0, 7.0 -0.63
PreCCF0462/Ornl m 3.0 2.35   5 1.05 0.782 1.0, 7.0 -0.83
PreCCF0467/Ornl f 3.33 2.31   3 1.33 0.693 2.0, 6.0 -0.58
PreCCF0467/Ornl m 4.0 2.83   2   2.0 0.707 2.0, 6.0 -0.23
PreCCF0475/Ornl f 7.0 0.0   1   0.0 0.0 7.0, 7.0 1.6
PreCCF0475/Ornl m 9.0 0.0   1   0.0 0.0 9.0, 9.0 2.74
PreCCF0477/Ornl f 2.0 0.0   2   0.0 0.0 2.0, 2.0 -1.37
PreCCF0477/Ornl m 3.0 1.41   2   1.0 0.471 2.0, 4.0 -0.83
PreCCF0481/Ornl f 2.0 1.41   2   1.0 0.707 1.0, 3.0 -1.37
PreCCF0481/Ornl m 2.0 1.41   2   1.0 0.707 1.0, 3.0 -1.42
PreCCF0489/Ornl f 3.33 0.577   3 0.333 0.173 3.0, 4.0 -0.58
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PreCCF0940/Ornl m 5.0 2.71   4 1.35 0.542 1.0, 7.0 0.36
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PreCCF0941/Ornl m 3.2 2.17   5 0.97 0.677 1.0, 6.0 -0.71
PreCCF0942/Ornl f 4.0 2.83   2   2.0 0.707 2.0, 6.0 -0.18
PreCCF0942/Ornl m 4.0 2.83   2   2.0 0.707 2.0, 6.0 -0.23
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PreCCF1608/Ornl m 3.0 1.41   2   1.0 0.471 2.0, 4.0 -0.83
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PreCCF2285/Ornl m 5.0 0.0   1   0.0 0.0 5.0, 5.0 0.36
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PreCCF2291/Ornl m 5.33 2.31   3 1.33 0.433 4.0, 8.0 0.56
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PreCCF2307/Ornl m 7.5 0.707   2   0.5 0.0943 7.0, 8.0 1.85
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PreCCF2489/Ornl m 6.0 0.0   1   0.0 0.0 6.0, 6.0 0.96
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PreCCF2533/Ornl m 2.5 2.12   2   1.5 0.849 1.0, 4.0 -1.12
PreCCF2558/Ornl f 4.0 2.0   5 0.894 0.5 1.0, 6.0 -0.18
PreCCF2558/Ornl m 4.6 1.14   5 0.51 0.248 3.0, 6.0 0.12
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WSB/EiJ m 4.25 3.59   4 1.8 0.846 1.0, 9.0 -0.08




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA