Project measure / variable:   Project1124   Parvibacter_pre

ID, description, units MPD:115048   Parvibacter_pre   Parvibacter   [%]  pre  
cocaine study
Data set, strains Project1124   CC   44 strains     sex: both
Procedure 16S rRNA Sequencing
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  STRAIN COMPARISON PLOT
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Project1124 - Parvibacter pre



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested38 strains35 strains
Mean of the strain means0.05537   % 0.0306   %
Median of the strain means0.00543029   % 0.0   %
SD of the strain means± 0.12387 ± 0.06222
Coefficient of variation (CV)2.2374 2.0336
Min–max range of strain means0.0   –   0.60723   % 0.0   –   0.2365   %
Mean sample size per strain1.0   mice 1.0   mice


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
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Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
CC001/UncJ f 0.02354 0.0   1   0.0 0.0 0.02354, 0.02354 -0.26
CC002/UncJ f 0.01163 0.0   1   0.0 0.0 0.01163, 0.01163 -0.35
CC002/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC003/UncJ m 0.05242 0.0   1   0.0 0.0 0.05242, 0.05242 0.35
CC004/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC005/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC005/TauUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC006/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC006/TauUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC007/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC008/GeniUncJ f 0.60723 0.0   1   0.0 0.0 0.60723, 0.60723 4.46
CC008/GeniUncJ m 0.06056 0.0   1   0.0 0.0 0.06056, 0.06056 0.48
CC009/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC009/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC010/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC011/UncJ f 0.0563 0.0   1   0.0 0.0 0.0563, 0.0563 0.01
CC011/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC012/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC012/GeniUncJ m 0.0083619 0.0   1   0.0 0.0 0.0083619, 0.0083619 -0.36
CC013/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC013/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC016/GeniUncJ f 0.06878 0.0   1   0.0 0.0 0.06878, 0.06878 0.11
CC017/UncJ m 0.02379 0.0   1   0.0 0.0 0.02379, 0.02379 -0.11
CC018/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC018/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC019/TauUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC020/GeniUncJ f 0.0105 0.0   1   0.0 0.0 0.0105, 0.0105 -0.36
CC020/GeniUncJ m 0.00462556 0.0   1   0.0 0.0 0.00462556, 0.00462556 -0.42
CC023/GeniUncJ f 0.03824 0.0   1   0.0 0.0 0.03824, 0.03824 -0.14
CC023/GeniUncJ m 0.10519 0.0   1   0.0 0.0 0.10519, 0.10519 1.2
CC024/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC026/GeniUncJ f 0.03627 0.0   1   0.0 0.0 0.03627, 0.03627 -0.15
CC026/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC027/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC027/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC028/GeniUncJ f 0.05248 0.0   1   0.0 0.0 0.05248, 0.05248 -0.02
CC028/GeniUncJ m 0.00371872 0.0   1   0.0 0.0 0.00371872, 0.00371872 -0.43
CC029/UncJ m 0.00865052 0.0   1   0.0 0.0 0.00865052, 0.00865052 -0.35
CC030/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC030/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC033/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC033/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC035/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC035/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC036/UncJ f 0.00688729 0.0   1   0.0 0.0 0.00688729, 0.00688729 -0.39
CC036/UncJ m 0.0213 0.0   1   0.0 0.0 0.0213, 0.0213 -0.15
CC040/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC041/TauUncJ f 0.30911 0.0   1   0.0 0.0 0.30911, 0.30911 2.05
CC043/GeniUncJ f 0.02695 0.0   1   0.0 0.0 0.02695, 0.02695 -0.23
CC043/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC044/UncJ f 0.02886 0.0   1   0.0 0.0 0.02886, 0.02886 -0.21
CC044/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC045/GeniUncJ f 0.06229 0.0   1   0.0 0.0 0.06229, 0.06229 0.06
CC045/GeniUncJ m 0.2365 0.0   1   0.0 0.0 0.2365, 0.2365 3.31
CC057/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC057/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC060/UncJ f 0.37568 0.0   1   0.0 0.0 0.37568, 0.37568 2.59
CC060/UncJ m 0.11545 0.0   1   0.0 0.0 0.11545, 0.11545 1.36
CC065/UncJ f 0.10132 0.0   1   0.0 0.0 0.10132, 0.10132 0.37
CC068/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC068/TauUncJ m 0.19802 0.0   1   0.0 0.0 0.19802, 0.19802 2.69
CC074/UncJ f 0.00393329 0.0   1   0.0 0.0 0.00393329, 0.00393329 -0.42
CC075/UncJ f 0.0039733 0.0   1   0.0 0.0 0.0039733, 0.0039733 -0.41
CC075/UncJ m 0.00721293 0.0   1   0.0 0.0 0.00721293, 0.00721293 -0.38
CC078/TauUncJ f 0.01511 0.0   1   0.0 0.0 0.01511, 0.01511 -0.32
CC078/TauUncJ m 0.02048 0.0   1   0.0 0.0 0.02048, 0.02048 -0.16
CC079/TauUncJ f 0.21464 0.0   1   0.0 0.0 0.21464, 0.21464 1.29
CC079/TauUncJ m 0.01331 0.0   1   0.0 0.0 0.01331, 0.01331 -0.28
CC080/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45
CC080/TauUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.49
CC083/UncJ f 0.05017 0.0   1   0.0 0.0 0.05017, 0.05017 -0.04
CC083/UncJ m 0.1913 0.0   1   0.0 0.0 0.1913, 0.1913 2.58
CC084/TauJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.45




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA